Protein–RNA interactions for Protein: Q99M03

Rwdd2b, RWD domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd2bQ99M03 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rwdd2bQ99M03 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms