Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q99KU6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q99KU6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q99KU6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q99KU6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Q99KU6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q99KU6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Q99KU6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q99KU6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q99KU6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q99KU6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q99KU6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q99KU6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q99KU6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q99KU6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q99KU6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q99KU6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q99KU6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q99KU6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q99KU6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q99KU6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q99KU6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q99KU6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q99KU6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Q99KU6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q99KU6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q99KU6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q99KU6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q99KU6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q99KU6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q99KU6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q99KU6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q99KU6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q99KU6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q99KU6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q99KU6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q99KU6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q99KU6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q99KU6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q99KU6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q99KU6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q99KU6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q99KU6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Q99KU6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q99KU6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q99KU6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q99KU6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q99KU6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q99KU6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q99KU6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q99KU6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q99KU6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q99KU6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q99KU6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q99KU6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q99KU6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q99KU6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q99KU6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q99KU6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q99KU6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q99KU6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q99KU6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q99KU6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q99KU6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q99KU6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Q99KU6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q99KU6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q99KU6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q99KU6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q99KU6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q99KU6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q99KU6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q99KU6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q99KU6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q99KU6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q99KU6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q99KU6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q99KU6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Q99KU6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q99KU6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q99KU6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q99KU6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q99KU6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q99KU6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q99KU6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q99KU6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q99KU6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q99KU6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q99KU6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Q99KU6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q99KU6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q99KU6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q99KU6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q99KU6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q99KU6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q99KU6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q99KU6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q99KU6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Q99KU6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q99KU6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms