Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms