Protein–RNA interactions for Protein: Q99JX1

Taf11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf11Q99JX1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf11Q99JX1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Taf11Q99JX1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Taf11Q99JX1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Taf11Q99JX1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Taf11Q99JX1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf11Q99JX1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf11Q99JX1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf11Q99JX1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf11Q99JX1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf11Q99JX1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf11Q99JX1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf11Q99JX1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf11Q99JX1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf11Q99JX1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf11Q99JX1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf11Q99JX1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf11Q99JX1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf11Q99JX1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf11Q99JX1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf11Q99JX1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf11Q99JX1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf11Q99JX1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms