Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cts3Q91ZD5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms