Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms