Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf4Q8VE97 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms