Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8VDP2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8VDP2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8VDP2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8VDP2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8VDP2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8VDP2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8VDP2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8VDP2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8VDP2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8VDP2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8VDP2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8VDP2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8VDP2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8VDP2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8VDP2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8VDP2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8VDP2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8VDP2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8VDP2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8VDP2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8VDP2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8VDP2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8VDP2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8VDP2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8VDP2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8VDP2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8VDP2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8VDP2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8VDP2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8VDP2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8VDP2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8VDP2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8VDP2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8VDP2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8VDP2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8VDP2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8VDP2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8VDP2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8VDP2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8VDP2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8VDP2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8VDP2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8VDP2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8VDP2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8VDP2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8VDP2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8VDP2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8VDP2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8VDP2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8VDP2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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