Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms