Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC6

Ccm2l, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2lQ8VCC6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms