Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1Q0

Stx19, Syntaxin-19, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx19Q8R1Q0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx19Q8R1Q0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms