Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nsl1Q8K305 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nsl1Q8K305 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nsl1Q8K305 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nsl1Q8K305 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nsl1Q8K305 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nsl1Q8K305 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nsl1Q8K305 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nsl1Q8K305 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsl1Q8K305 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsl1Q8K305 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsl1Q8K305 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsl1Q8K305 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsl1Q8K305 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsl1Q8K305 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsl1Q8K305 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsl1Q8K305 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsl1Q8K305 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsl1Q8K305 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsl1Q8K305 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsl1Q8K305 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsl1Q8K305 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsl1Q8K305 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsl1Q8K305 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsl1Q8K305 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsl1Q8K305 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsl1Q8K305 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsl1Q8K305 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsl1Q8K305 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsl1Q8K305 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsl1Q8K305 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsl1Q8K305 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsl1Q8K305 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsl1Q8K305 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms