Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W3

Txndc11, Thioredoxin domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc11Q8K2W3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms