Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms