Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms