Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Usp27Q8CEG8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
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Usp27Q8CEG8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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Usp27Q8CEG8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Usp27Q8CEG8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Usp27Q8CEG8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Usp27Q8CEG8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Usp27Q8CEG8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Usp27Q8CEG8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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