Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD94

Lin52, Protein lin-52 homolog, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin52Q8CD94 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lin52Q8CD94 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lin52Q8CD94 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lin52Q8CD94 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lin52Q8CD94 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lin52Q8CD94 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lin52Q8CD94 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lin52Q8CD94 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lin52Q8CD94 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lin52Q8CD94 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lin52Q8CD94 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lin52Q8CD94 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lin52Q8CD94 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lin52Q8CD94 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lin52Q8CD94 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lin52Q8CD94 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lin52Q8CD94 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lin52Q8CD94 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lin52Q8CD94 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lin52Q8CD94 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lin52Q8CD94 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Lin52Q8CD94 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Lin52Q8CD94 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lin52Q8CD94 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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