Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6K9

Col6a6, Collagen alpha-6(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a6Q8C6K9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a6Q8C6K9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms