Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL7

Arfrp1, ADP-ribosylation factor-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfrp1Q8BXL7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfrp1Q8BXL7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms