Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp5Q8BX09 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms