Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rufy1Q8BIJ7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms