Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms