Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms