Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChfrQ810L3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms