Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc27Q80YS5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc27Q80YS5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc27Q80YS5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc27Q80YS5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc27Q80YS5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc27Q80YS5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc27Q80YS5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc27Q80YS5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc27Q80YS5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc27Q80YS5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc27Q80YS5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc27Q80YS5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc27Q80YS5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc27Q80YS5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc27Q80YS5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc27Q80YS5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Lrrc27Q80YS5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Lrrc27Q80YS5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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