Protein–RNA interactions for Protein: Q80T74

Klhl29, Kelch-like protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl29Q80T74 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klhl29Q80T74 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms