Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms