Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TwistnbQ78WZ7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms