Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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