Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR6

Syne1, Nesprin-1, mousemouse

Predictions only

Length 8,799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne1Q6ZWR6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms