Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl3Q6W5C0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms