Protein–RNA interactions for Protein: Q6UGQ3

Scgb2b2, Secretoglobin family 2B member 2, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb2b2Q6UGQ3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scgb2b2Q6UGQ3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Scgb2b2Q6UGQ3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scgb2b2Q6UGQ3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scgb2b2Q6UGQ3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Scgb2b2Q6UGQ3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Scgb2b2Q6UGQ3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scgb2b2Q6UGQ3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scgb2b2Q6UGQ3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scgb2b2Q6UGQ3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scgb2b2Q6UGQ3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scgb2b2Q6UGQ3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scgb2b2Q6UGQ3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scgb2b2Q6UGQ3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scgb2b2Q6UGQ3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b2Q6UGQ3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b2Q6UGQ3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b2Q6UGQ3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b2Q6UGQ3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b2Q6UGQ3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b2Q6UGQ3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b2Q6UGQ3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b2Q6UGQ3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b2Q6UGQ3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b2Q6UGQ3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b2Q6UGQ3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b2Q6UGQ3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b2Q6UGQ3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b2Q6UGQ3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b2Q6UGQ3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b2Q6UGQ3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b2Q6UGQ3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b2Q6UGQ3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b2Q6UGQ3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b2Q6UGQ3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b2Q6UGQ3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scgb2b2Q6UGQ3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scgb2b2Q6UGQ3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scgb2b2Q6UGQ3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Scgb2b2Q6UGQ3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scgb2b2Q6UGQ3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms