Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJN8

Dalrd3, DALR anticodon-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dalrd3Q6PJN8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Dalrd3Q6PJN8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dalrd3Q6PJN8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dalrd3Q6PJN8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dalrd3Q6PJN8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dalrd3Q6PJN8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dalrd3Q6PJN8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dalrd3Q6PJN8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dalrd3Q6PJN8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dalrd3Q6PJN8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Dalrd3Q6PJN8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Dalrd3Q6PJN8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dalrd3Q6PJN8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dalrd3Q6PJN8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dalrd3Q6PJN8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dalrd3Q6PJN8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dalrd3Q6PJN8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dalrd3Q6PJN8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dalrd3Q6PJN8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dalrd3Q6PJN8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dalrd3Q6PJN8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dalrd3Q6PJN8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms