Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE3

Rrm2b, Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2 B, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrm2bQ6PEE3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrm2bQ6PEE3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rrm2bQ6PEE3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rrm2bQ6PEE3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rrm2bQ6PEE3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rrm2bQ6PEE3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rrm2bQ6PEE3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrm2bQ6PEE3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrm2bQ6PEE3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrm2bQ6PEE3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrm2bQ6PEE3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrm2bQ6PEE3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrm2bQ6PEE3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrm2bQ6PEE3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrm2bQ6PEE3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrm2bQ6PEE3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrm2bQ6PEE3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrm2bQ6PEE3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrm2bQ6PEE3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrm2bQ6PEE3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrm2bQ6PEE3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrm2bQ6PEE3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrm2bQ6PEE3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrm2bQ6PEE3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrm2bQ6PEE3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrm2bQ6PEE3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrm2bQ6PEE3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrm2bQ6PEE3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrm2bQ6PEE3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrm2bQ6PEE3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrm2bQ6PEE3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrm2bQ6PEE3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms