Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dtx4Q6PDK8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms