Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Top2bQ64511 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Top2bQ64511 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Top2bQ64511 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Top2bQ64511 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Top2bQ64511 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Top2bQ64511 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Top2bQ64511 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Top2bQ64511 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Top2bQ64511 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Top2bQ64511 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Top2bQ64511 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Top2bQ64511 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Top2bQ64511 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Top2bQ64511 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Top2bQ64511 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Top2bQ64511 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Top2bQ64511 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Top2bQ64511 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Top2bQ64511 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Top2bQ64511 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Top2bQ64511 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Top2bQ64511 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Top2bQ64511 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Top2bQ64511 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Top2bQ64511 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Top2bQ64511 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Top2bQ64511 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Top2bQ64511 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Top2bQ64511 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Top2bQ64511 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Top2bQ64511 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Top2bQ64511 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Top2bQ64511 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
Top2bQ64511 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Top2bQ64511 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms