Protein–RNA interactions for Protein: Q64455

Ptprj, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, mousemouse

Predictions only

Length 1,238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprjQ64455 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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PtprjQ64455 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprjQ64455 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprjQ64455 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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PtprjQ64455 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
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PtprjQ64455 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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PtprjQ64455 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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PtprjQ64455 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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PtprjQ64455 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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PtprjQ64455 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprjQ64455 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprjQ64455 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprjQ64455 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprjQ64455 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprjQ64455 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprjQ64455 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprjQ64455 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprjQ64455 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprjQ64455 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprjQ64455 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprjQ64455 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprjQ64455 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprjQ64455 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprjQ64455 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprjQ64455 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprjQ64455 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprjQ64455 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprjQ64455 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprjQ64455 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprjQ64455 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprjQ64455 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprjQ64455 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprjQ64455 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprjQ64455 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms