Protein–RNA interactions for Protein: Q64318

Zeb1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb1Q64318 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zeb1Q64318 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms