Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
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Ccdc18Q640L5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc18Q640L5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ccdc18Q640L5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Ccdc18Q640L5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Ccdc18Q640L5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc18Q640L5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc18Q640L5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc18Q640L5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc18Q640L5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc18Q640L5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc18Q640L5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc18Q640L5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc18Q640L5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc18Q640L5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc18Q640L5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc18Q640L5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc18Q640L5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc18Q640L5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc18Q640L5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc18Q640L5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc18Q640L5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc18Q640L5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc18Q640L5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc18Q640L5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc18Q640L5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc18Q640L5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc18Q640L5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc18Q640L5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
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