Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms