Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PcolceQ61398 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PcolceQ61398 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PcolceQ61398 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PcolceQ61398 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PcolceQ61398 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PcolceQ61398 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PcolceQ61398 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PcolceQ61398 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PcolceQ61398 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PcolceQ61398 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PcolceQ61398 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PcolceQ61398 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PcolceQ61398 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PcolceQ61398 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PcolceQ61398 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PcolceQ61398 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PcolceQ61398 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PcolceQ61398 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PcolceQ61398 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PcolceQ61398 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PcolceQ61398 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PcolceQ61398 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PcolceQ61398 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcolceQ61398 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcolceQ61398 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcolceQ61398 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PcolceQ61398 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PcolceQ61398 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PcolceQ61398 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcolceQ61398 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcolceQ61398 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PcolceQ61398 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PcolceQ61398 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PcolceQ61398 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PcolceQ61398 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcolceQ61398 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcolceQ61398 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcolceQ61398 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcolceQ61398 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcolceQ61398 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PcolceQ61398 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcolceQ61398 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcolceQ61398 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcolceQ61398 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcolceQ61398 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcolceQ61398 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PcolceQ61398 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcolceQ61398 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcolceQ61398 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcolceQ61398 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PcolceQ61398 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PcolceQ61398 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PcolceQ61398 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PcolceQ61398 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PcolceQ61398 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PcolceQ61398 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PcolceQ61398 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PcolceQ61398 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PcolceQ61398 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PcolceQ61398 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PcolceQ61398 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PcolceQ61398 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PcolceQ61398 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PcolceQ61398 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PcolceQ61398 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PcolceQ61398 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PcolceQ61398 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PcolceQ61398 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PcolceQ61398 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PcolceQ61398 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PcolceQ61398 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
PcolceQ61398 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcolceQ61398 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcolceQ61398 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcolceQ61398 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcolceQ61398 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcolceQ61398 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcolceQ61398 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcolceQ61398 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcolceQ61398 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcolceQ61398 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcolceQ61398 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PcolceQ61398 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcolceQ61398 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcolceQ61398 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcolceQ61398 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PcolceQ61398 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcolceQ61398 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcolceQ61398 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcolceQ61398 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcolceQ61398 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PcolceQ61398 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcolceQ61398 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcolceQ61398 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcolceQ61398 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcolceQ61398 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcolceQ61398 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcolceQ61398 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcolceQ61398 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms