Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ift20Q61025 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ift20Q61025 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ift20Q61025 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ift20Q61025 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ift20Q61025 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ift20Q61025 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ift20Q61025 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ift20Q61025 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ift20Q61025 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ift20Q61025 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ift20Q61025 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ift20Q61025 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ift20Q61025 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ift20Q61025 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ift20Q61025 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ift20Q61025 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ift20Q61025 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ift20Q61025 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ift20Q61025 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ift20Q61025 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ift20Q61025 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ift20Q61025 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ift20Q61025 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ift20Q61025 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ift20Q61025 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ift20Q61025 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ift20Q61025 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ift20Q61025 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ift20Q61025 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ift20Q61025 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ift20Q61025 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms