Protein–RNA interactions for Protein: Q5U406

Zfp78, Zinc finger protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp78Q5U406 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms