Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms