Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xirp2Q4U4S6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms