Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SbsponQ3UPR9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SbsponQ3UPR9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms