Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cog7Q3UM29 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms