Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms