Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms