Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem35bQ3U0Y2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms